Phân tích tần số đột biến gen kháng kháng sinh ở Salmonella và sàng lọc hợp chất kháng sinh tự nhiên tiềm năng bằng sàng lọc ảo

Abstract

Nghiên cứu nhằm sàng lọc các hợp chất có nguồn gốc từ thảo mộc, có khả năng kháng Salmonella thông qua việc ức chế gen kháng kháng sinh. Từ việc thu nhận 242 trình tự bộ gen, tôi đã xử lý chúng với ResFinder 4.1 và cho kết quả aadA22 là gen kháng kháng sinh xuất hiện chủ yếu trong tổng số trình tự đã khảo sát. Để sàng lọc các hợp chất, trước tiên tôi đã chuẩn bị protein mục tiêu (ID:4CS6) – có vai trò quan trọng trong việc liên kết với phối tử để ức chế sự hình thành gen aadA22. Đồng thời, tôi đã xây 120 hợp chất có nguồn gốc từ các loại thảo mộc tự nhiên thông qua các công cụ tin sinh học. Dựa vào phương pháp phân tích tần số đột biến gen kháng kháng sinh và xác định năng lượng liên kết, tôi đã lựa chọn bốn hợp chất tiềm năng bao gồm: Reserpine, Terebinthone, Sugiol, Quercetin; trong đó Reserpin là một hợp chất đầy triển vọng góp phần vào việc nghiên cứu trong tương lai.